שימוש בחומרים אנטימיקרוביאלים מקובל במשקי החלב לטיפול ומניעת דלקות עטין. החומרים נמצאים בהישג ידו של החקלאי או ניתנים על פי מירשם הרופא.
הגישה המקובלת כיום אומרת כי הטיפול קליני ניתן ברגע התלקחות הדלקת (דלקת קלינית) והטיפול התת קליני ניתן בעיקר בתקופת  "היובש".
 
לפי מבחני רגישות יש מבחר גדול של אנטיביוטיקות שניתן לטפל בהם, במיוחד בדלקות עטין מגורמים גרם חיובים. כדי להבין ולהצדיק את הטיפול האנטימיקרוביאלי יש מקום להבין שני מושגי יסוד בפרמקולוגיה. פרמקוקינטיקה - מלמדת איך התרופה מתנהגת בגוף ופרמקודינמיקה - מה עושה האנטיביוטיקה לחיידק. רק התחשבות והבנה של שני מושגים אלו, כולל זיהוי והכרת החיידק המעורב בדלקת  מאפשרת לתת טיפול יעיל ונכון מקצועית בדלקות עטין.
 
איך ניתן את  טיפול כנגד דלקת עטין?
סיסטמי (בהזרקה לגוף), תוך עטיני, או שניהם יחד. הכל תלוי כמובן בהכרת ההיבטים הפרמקודינמים והפרמקוקינטים של התרופה מול החיידקים.

מטרות כל טיפול: להגיע לשיא פעילות של האנטיביוטיקה ללא פעילות טוקסית  למאחסן (פרה ,צאן). חשוב  לדעת ולהכיר מהו הריכוז היעיל  שהחומר אמור להגיע  לעטין/חלב כדי שיהיה אפקיטיבי מול החיידק/ים הנמצאים במקום. גם למשך זמן הטיפול ולמינון הניתן  יש חשיבות רבה בהצלחת הטיפול. יש לקחת בחשבון בהתחלת כל מתן טיפולי שלם מהם העלויות הצפויות  במהלך כל ימי הטיפול כולל ימים להפרדת החלב המטופל (חומרי טיפול  +כמות שפיכת החלב).
אי הצלחת הטיפול נובעת מכשל באחד מההיבטים שנסקרו קודם לכן.

המלצות למטפל: הכר את התרופה וכמובן דע כנגד מי היא ניתנת. הכר את יכולת התרופה להגיע לריכוז יעיל בעטין וכל זאת במשך מינון וזמן קבועים מראש. לפני התחלת הטיפול יש לחשב במקביל את העלויות הנדרשות לשם כך.החוקרים חייבים להוסיף ולחפש שיטות חדשות למתן הטיפול כדי להגיע לריכוזים הרצויים במשך הזמן הקצר, היעיל והזול ביותר.